Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC4Q92889 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms