Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF4BQ92750 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF4BQ92750 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TAF4BQ92750 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF4BQ92750 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF4BQ92750 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF4BQ92750 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF4BQ92750 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF4BQ92750 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF4BQ92750 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF4BQ92750 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms