Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RGP1Q92546 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms