Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms