Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF680Q8NEM1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF680Q8NEM1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms