Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms