Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG2Q8NC44 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG2Q8NC44 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms