Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf106Q8NAJ2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms