Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms