Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms