Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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