Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms