Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC50Q8IVM0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC50Q8IVM0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC50Q8IVM0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC50Q8IVM0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC50Q8IVM0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC50Q8IVM0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC50Q8IVM0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC50Q8IVM0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC50Q8IVM0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC50Q8IVM0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms