Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms