Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms