Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms