Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms