Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms