Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms