Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD7BQ6GQQ9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD7BQ6GQQ9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms