Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms