Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms