Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM236Q5W0B7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms