Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms