Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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