Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms