Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms