Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP188Q5SRE5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms