Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms