Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms