Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms