Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.5 ms