Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms