Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms