Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZC2HC1CQ53FD0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms