Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms