Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms