Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ME3Q16798 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME3Q16798 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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