Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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