Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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FXNQ16595 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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FXNQ16595 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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FXNQ16595 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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FXNQ16595 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FXNQ16595 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FXNQ16595 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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