Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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