Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PCSK7Q16549 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PCSK7Q16549 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PCSK7Q16549 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PCSK7Q16549 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCSK7Q16549 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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