Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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