Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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