Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USF2Q15853 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USF2Q15853 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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