Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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