Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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