Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
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