Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP13Q15645 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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