Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms